doc/Objects/Contour.html

   1 <HR>
   2 <A NAME="Information">
   3 <H2>Information from source codes</H2>
   4 </A>
   5 <PRE>
   6 </PRE>
   7 <HR>
   8 <A NAME="include">
   9 <H2>Contour.h</H2>
  10 </A>
  11 <PRE>
  12 #ifndef CONTOUR_H
  13 #define CONTOUR_H
  14 /*
  15     contour.h
  16 */
  17 #include  "genUtil.h"
  18
  19 #ifndef MINFLOAT
  20 #define MINFLOAT (1e-31)
  21 #endif
  22
  23 #include "mrcImage.h"
  24 /* constant begin */
  25 #define CONTOUR_ACCURACY  (MINFLOAT)
  26 /* constant end */
  27
  28 /* struct begin */
  29 typedef long   contourParaTypeInteger;
  30 typedef double contourParaTypeReal;
  31
  32 typedef struct contourParaElement {
  33     contourParaTypeInteger n;
  34     contourParaTypeReal    Min;
  35     contourParaTypeReal    Max;
  36     contourParaTypeReal    d;
  37 } contourParaElement;
  38
  39 typedef struct contourImage {
  40     contourParaTypeReal* image;
  41     contourParaTypeReal* image2;
  42     contourParaElement   x;
  43     contourParaElement   y;
  44     contourParaElement   z;
  45     contourParaElement   w;
  46     contourParaElement   h;
  47     contourParaTypeReal  section;
  48 } contourImage;
  49
  50 typedef struct contourPoint {
  51     contourParaTypeReal    x;
  52     contourParaTypeReal    y;
  53     contourParaTypeReal    z;
  54 } contourPoint;
  55
  56 typedef struct contourALine contourALine;
  57 struct contourALine {
  58     contourALine* before;
  59     contourPoint p0;
  60     contourPoint p1;
  61     contourPoint p2;
  62     contourALine* next;
  63 };
  64
  65 typedef struct contourLine contourLine;
  66 struct contourLine {
  67     contourALine* top;
  68     contourALine* current;
  69     contourParaTypeInteger n;
  70     contourLine*  next;
  71 };
  72
  73 typedef struct contourLines contourLines;
  74 struct contourLines {
  75     contourLine*  top;
  76     contourLine*  current;
  77     contourParaTypeInteger n;
  78     contourLines* next;
  79 };
  80
  81 typedef struct contourLinesSet contourLinesSet;
  82 struct contourLinesSet {
  83     contourLines*  top;
  84     contourLines*  current;
  85     contourParaTypeInteger n;
  86     contourLinesSet* next;
  87 };
  88
  89 typedef struct contourArgs {
  90     contourParaTypeReal f00;  /* For 2D Contour*/
  91     contourParaTypeReal f01;
  92     contourParaTypeReal f11;
  93     contourParaTypeReal f10;
  94     contourParaTypeReal f000; /* For 3D Contour */
  95     contourParaTypeReal f001;
  96     contourParaTypeReal f010;
  97     contourParaTypeReal f011;
  98     contourParaTypeReal f100;
  99     contourParaTypeReal f101;
 100     contourParaTypeReal f110;
 101     contourParaTypeReal f111;
 102     contourParaTypeReal x;
 103     contourParaTypeReal y;
 104     contourParaTypeReal z;
 105     contourParaTypeReal dx;
 106     contourParaTypeReal dy;
 107     contourParaTypeReal dz;
 108 } contourArgs;
 109
 110 typedef enum contourFlag {
 111     contourFlagXSection,
 112     contourFlagYSection,
 113     contourFlagZSection,
 114     contourFlag3D
 115 } contourFlag;
 116 /* struct end */
 117
 118 /* prototype begin */
 119 /* search contour lines in a boxel */
 120 extern void createContourALine(contourLine* ls, contourArgs c);
 121
 122 /* create contour lines in order */
 123 extern void createContourLine (contourLines*  ls, contourLine* l);
 124
 125 /* craete contourLines at each section */
 126 extern void createContourLines(contourLines* ls, contourImage image);
 127
 128 /* create contourLines at all sections */
 129 extern void createContour(contourLinesSet* lsset, contourImage image, contourParaTypeReal level, contourFlag flag);
 130
 131 extern void appendContourLine0(contourLine* l, contourParaTypeReal xc1, contourParaTypeReal yc1, contourParaTypeReal xc2, contourParaTypeReal yc2, contourParaTypeReal z);
 132 extern void appendContourLine1(contourLine* l, contourLine* als);
 133
 134 extern void lmrc2contour(contourLinesSet* c, mrcImage* m, contourParaTypeReal l, contourFlag f, long mode);
 135 /* prototype end */
 136
 137 #endif /* CONTOUR_H */
 138 </PRE>