doc/SmallTools/mrcFETnormalizeBySD.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>mrcFETnormalizeBySD</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>mrcFETnormalizeBySD</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: mrcFETnormalizeBySD
  10 Options:
  11     [-i[nput]            In                  (NULL      ).as(inFile              ) ] :Essential :InputFileList
  12     [-i[nput]s[ample]    InSample            (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :FileListforSDcalc
  13     [-r[ead]SD           readSD              (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :readFETSDfile
  14     [-w[rite]SD          writeSD             (NULL      ).as(outFile             ) ] :Optional  :writeFETSDfile
  15     [-o[utput]           Out                 (NULL      ).as(outFile             ) ] :Optional  :OutputASmrcImage
  16     [-c[onfig]           configFile          (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :ConfigurationFile
  17     [-m[ode]             mode                (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :Mode
  18
  19 ----- Additional Usage -----
  20 -is  :[inputsample] is FileList for SDcalculation.
  21            use when the inputFileList is large
  22 -rSD : to use SDdata(without calculate) mrc format
  23 -wSD : write out the SDdata as mrc format
  24        this file can be used next normalize with "-rSD"command.
  25 -o   : save all normalized data into one mrcImage.
  26        do not use when the inputFileList is large
  27
  28 </PRE>
  29 </BODY>
  30 </HTML>