doc/SmallTools/mrcImageDensityInfo.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>mrcImageDensityInfo</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>mrcImageDensityInfo</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: mrcImageDensityInfo
  10 Options:
  11     [-i[nput]            In                  (NULL      ).as(inFile              ) ] :Essential :InputDataFile
  12     [-o[utput]           Out                 (stdout    ).as(outFile             ) ] :Optional  :OutputDataFile
  13     [-C[ontour]          Contour             (10        ).as(Real                ) ] :Optional  :ContourLevel: 10 5.533535e-322ach
  14     [-log                Log                 (NULL      ).as(appendFile          ) ] :Optional  :OutputDataFile
  15     [-c[onfig]           configFile          (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :ConfigurationFile
  16     [-m[ode]             mode                (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :Mode
  17 ----- Attention !!!-----
  18 In Eos system, positive values are regarded as density.
  19 If a pixel has a negative value, the value of the pixel is regarded as zero.lmrcImageDensityInfo Mode:
  20 1: PercentageVolume
  21 2: CentreOfGravity
  22 4: Max
  23 8: SD around CentreOfGravity
  24 16: SD around Max
  25 </PRE>
  26 </BODY>
  27 </HTML>