doc/SmallTools/mrcImageFourierShellCorrelation.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>mrcImageFourierShellCorrelation</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>mrcImageFourierShellCorrelation</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: mrcImageFourierShellCorrelation
  10 Options:
  11     [-i1[input1]         In1                 (NULL      )] :Optional  :InputDataFile
  12     [-i2[input2]         In2                 (NULL      )] :Optional  :InputDataFile
  13     [-d[elta]            delta               (0         )] :Optional  :Interval of output data(1/A). Default 1/(Nx*size of pixel)
  14     [-z[position]        z                   (0         )] :Optional  :z position of reference file to correlate.For mode2=1 only
  15     [-L[owThreshold]     L                   (0         )] :Optional  :Low threshold for mode +2.
  16     [-H[ighThreshold]    H                   (0         )] :Optional  :High threshold for mode +2.
  17     [-c[onfig]           configFile          (NULL      )] :Optional  :ConfigurationFile
  18     [-m[ode]             mode                (0         )] :Optional  :Mode
  19     [-M[ode2]            mode2               (0         )] :Optional  :Mode2
  20     [-I1[nput array of file]In1Array            (stdin     )] :Optional  :InputDataFiles
  21 ----- mode -----
  22 0: Fourier shell correlation.
  23 1: Fourier shell phase residual.
  24 +2: Correlation between L and H
  25 +4: Without equator.
  26 ----- mode 2 -----
  27 0: Correlation between same size images
  28 1: Correlation between 2D image and image extracted from 3D image.
  29 +2: Correlation between 2D different size images. In1 is compared with center of In2.
  30 </PRE>
  31 </BODY>
  32 </HTML>