doc/SmallTools/mrcImageMaskingByImage.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>mrcImageMaskingByImage</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>mrcImageMaskingByImage</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: mrcImageMaskingByImage
  10 Options:
  11     [-i[nput]            In                  (NULL      ).as(inFile              ) ] :Essential :InputDataFile
  12     [-o[utput]           Out                 (NULL      ).as(outFile             ) ] :Essential :OutputDataFile
  13     [-M[askingFile]      MaskFile            (NULL      ).as(inFile              ) ] :Essential :FilenameForMasking
  14     [-v[alueForCut]      CutValue            (0         ).as(Real                ) ] :Optional  :ValueForCut
  15     [-c[onfig]           configFile          (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :ConfigurationFile
  16     [-m[ode]             mode                (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :Mode
  17 mode = 0  : cut off values larger that CutValue.
  18 mode = 1  : cut off values smaller that CutValue.
  19 mode = 2  : multiplying mask image
  20 mode = +16 : Subtract the average of ROI from the density
  21 </PRE>
  22 </BODY>
  23 </HTML>