doc/SmallTools/mrcImageROI.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>mrcImageROI</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>mrcImageROI</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: mrcImageROI
  10 Options:
  11     [-i[nput]            In                  (NULL      )] :Essential :InputDataFile
  12     [-o[utput]           Out                 (NULL      )] :Essential :OutputDataFile
  13     [-r[oi]              blx                 (0.0       )bly                 (0.0       )brx                 (0.0       )bry                 (0.0       )trx                 (0.0       )try                 (0.0       )tlx                 (0.0       )tly                 (0.0       )] :Optional  :Rectangle ROI
  14     [-x                  WidthBeforeExpansion(1.0/* Default is set by -r */)] :Optional  :Width  before expansion
  15     [-y                  HeightBeforeExpansion(1.0/* Default is set by -r */)] :Optional  :Height before expansion
  16     [-a[ngle]            Angle               (0.0       )] :Optional  :This value [degree] is added to angle of current source image.
  17     [-W                  WidthAfterExpansion (1.0       )] :Optional  :Width  after expansion[Pixel]
  18     [-H                  HeightAfterExpansion(1.0       )] :Optional  :Height after expansion[Pixel]:
  19                 ROI Size is (10,20):
  20                         If -W 30 -H 40, out (30,40)
  21                         If -W 30, out (30, 20*30/10)
  22                         If -H 40, out (10*40/20,40)
  23                                 If omitted, out (10,20)
  24     [-Shift              ShiftX              (0.0       )ShiftY              (0.0       )] :Optional  :ROI ARea Shift [Pixel]
  25     [-turePitch          truePitch           (430.0     )] :Optional  :truePitch [A]
  26     [-dY                 dY                  (0.0       )] :Optional  :Number of turePitch
  27     [-Ly                 Ly                  (5.0       )] :Optional  :Header Length y [A/Pixel]
  28     [-S[hrink]           Shrink              (1         )] :Optional  :When inputfile is shrinked
  29     [-c[onfig]           configFile          (NULL      )] :Optional  :ConfigurationFile
  30     [-m[ode]             mode                (0         )] :Optional  :Mode
  31 ---- mode ----
  32         0: Nearest Neighbor Method
  33         1: Bilinear method
  34         2: Cubic Convolution method
  35         3: Polynominal method
  36 ---- Note  (Magnification change for normalize)----
  37 -truePitch, -dY and -Ly options make
  38 H[pixel] = truePitch[A] / Ly[A/pixel] x dY
  39 </PRE>
  40 </BODY>
  41 </HTML>