doc/SmallTools/mrcImagesSinogramCorrelation.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>mrcImagesSinogramCorrelation</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>mrcImagesSinogramCorrelation</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: mrcImagesSinogramCorrelation
  10 Options:
  11     [-I[nputList]        In                  (NULL      ).as(inFileList          ) ] :Essential :InputDataFileList
  12     [-o[utput]H[eader]   OutHeader           (test      ).as(String              ) ] :Optional  :OutputDataFileHeader
  13     [-R[sults]d[irectoryname]Rd                  (Result    ).as(String              ) ] :Optional  :output results directory name
  14     [-N[ormalCorrelation]d[irectoryname]Nd                  (Normal    ).as(String              ) ] :Optional  :directory name of output normalcorrelation in results directory
  15     [-D[erivation]1[DCorrelation]d[irectoryname]D1d                 (Derivation1D).as(String              ) ] :Optional  :directory name of output derivation1Dcorrelation in results directory
  16     [-D[erivation]2[DCorrelation]d[irectoryname]D2d                 (Derivation2D).as(String              ) ] :Optional  :directory name of output derivation2Dcorrelation in results directory
  17     [-L[engthCorrelation]d[irectoryname]Ld                  (Length    ).as(String              ) ] :Optional  :directory name of output lengthcorrelation in results directory
  18     [-C[orrelation]E[xtension]CorrelationExtension(cor       ).as(String              ) ] :Optional  :output correlation file extension
  19     [-L[ist]E[xtension]  ListExtension       (list      ).as(String              ) ] :Optional  :output file list extension
  20     [-c[onfig]           configFile          (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :ConfigurationFile
  21     [-m[ode]             mode                (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :Mode
  22     [-N[ormalCorrelation]m[ode]Nmode               (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :
  23     [-D[erivation]1[DCorrelation]m[ode]D1mode              (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :
  24     [-D[erivation]2[DCorrelation]m[ode]D2mode              (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :
  25     [-L[engthCorrelation]m[ode]Lmode               (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :
  26     [-L[ength]T[hreshold]M[ode]LengthThresholdMode (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :LengthThresholdMode
  27     [-L[ength]T[hreshold]M[ode]LengthThresholdRatio(0.25      ).as(Real                ) ] :Optional  :LengthThresholdRatio
  28     [-C[reate]M[ode]     CM                  (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :CreateMode
  29
  30 ----- create mode -----
  31 -CM : 0 : image of correlation and list
  32       1 : list only
  33
  34 ----- mode -----
  35 >>Nmode  : 0 :     creat normal correlation       (-Nd)
  36            1 : not creat normal correlation
  37 >>D1mode : 0 :     creat derivation1D correlation (-D1d)
  38            1 : not creat derivation1D correlation
  39 >>D2mode : 0 :     creat derivation2D correlation (-D2d)
  40            1 : not creat derivation2D correlation
  41 >>Lmode  : 0 :     creat length correlation       (-Ld, -LTM, -LTR)
  42            1 : not creat length correlation
  43
  44 ----- directory and file -----
  45 >>create directory : Rd
  46                    : Rd/Nd (D1d, D2d, Ld)
  47
  48 >>create list file        : Rd/Nd/oH-Nd.LE
  49                            (Result/Normal/test-Normal.list)
  50
  51 >>create correlation file : Rd/Nd/infile1_infile2.Nd.CE
  52                            (Result/Normal/test1_test2.Normal.cor)
  53 </PRE>
  54 </BODY>
  55 </HTML>