doc/SmallTools/mrcSinogramFETreferredCorrelation.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>mrcSinogramFETreferredCorrelation</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>mrcSinogramFETreferredCorrelation</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: mrcSinogramFETreferredCorrelation
  10 Options:
  11     [-i[nput]            In                  (NULL      )] :Essential :InputFETDataFileList
  12     [-o[utput]           Out                 (NULL      )] :Essential :OutputEulerAngleDataFileList
  13     [-i[nput]Ref         InR                 (NULL      )] :Essential :InputReferenceFETDataFileList
  14     [-i[nput]Euler       InE                 (NULL      )] :Essential :InputEulerAngleDataFile
  15     [-n[ormalize]m[ode]  NM                  (0         )] :Optional  :normalizeMode
  16     [-o[utputList]m[ode] OM                  (2         )] :Optional  :outputListMode
  17     [-t[op]n[um]         TN                  (10        )] :Optional  :top number
  18     [-refR[ange]         RR                  (15        )] :Optional  :reference select Range
  19     [-w[eight]           WEIGHT              (NULL      )] :Optional  :CorrelationCalcWeight
  20     [-c[onfig]           configFile          (NULL      )] :Optional  :ConfigurationFile
  21     [-m[ode]             mode                (0         )] :Optional  :Mode
  22 ----- Additional Usage -----
  23
  24 Input EulerAngleDataFile example
  25 file1   YOYS    -30     60      0
  26 file2   YOYS    -53.24  10.000  0
  27 ...
  28
  29 normalizeMode 0 : normalize with average and SD of whole inputfile
  30                   references and datas will be normalize independently
  31               1 : for using normalized inputFETdata
  32
  33 outputListMode 0 : output anglelist  only top1 angle set
  34                1 :                   selected angle sets
  35                2 :                   top -tn angle sets
  36    option -tn,-refR are for outputListMode!=0
  37     -tn   : number of referenceMaps be considerd in selection
  38     -refR : step size when generate referenceMapSet from 3D image is recommend
  39 </PRE>
  40 </BODY>
  41 </HTML>