doc/SmallTools/pdbCrystalCreate.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>pdbCrystalCreate</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>pdbCrystalCreate</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: pdbCrystalCreate
  10 Options:
  11     [-i[nput]            In                  (NULL      ).as(inFile              ) ] :Essential :Input:PDB
  12     [-I[nfo]             Info                (NULL      ).as(inFile              ) ] :Essential :Input:Crystal Information
  13     [-o[utput]           Out                 (NULL      ).as(outFile             ) ] :Essential :Output:PDB
  14     [-c[onfig]           configFile          (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :ConfigurationFile
  15     [-m[ode]             mode                (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :Mode
  16 ----- Additional Usage -----
  17 ----- CrystalInfo -----
  18 aAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
  19 bAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
  20 cAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
  21 CellLength  %15.6g %15.6g %15.6g
  22 Origin      %15.6g %15.6g %15.6g
  23 N           %15d %15d %15d
  24 StartN      %15d %15d %15d
  25 SpaceGroup  %15d
  26 HelixInfo   %10d %10d %10d
  27 ### Attention ###
  28 Parameter Order is important: Dependent between CellLength and a|b|cAxis.
  29                               Because each of aAxis, bAxis, cAxis must be a unit vector.
  30 HelixInfo   t  u  n
  31 ----- CrystalSpaceGroup -----
  32     0 P1
  33     1 HelicalSymmmetry
  34 </PRE>
  35 </BODY>
  36 </HTML>