doc/SmallTools/pdbTrans.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>pdbTrans</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>pdbTrans</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: pdbTrans
  10 Options:
  11     [-i[nput]            inFile              (NULL      )] :Essential :Input: DataFile
  12     [-o[utput]           outFile             (NULL      )] :Essential :Output: DataFile
  13     [-M[atrix]           matFile             (NULL      )] :Optional  :Input: MatrixFile[4][4]
  14     [-E[uler]A[ngle]     RotMode             (YOYS      )Rot1                (0.0       )Rot2                (0.0       )Rot3                (0.0       )] :Optional  :Input:
  15     [-c[onfig]           configFile          (NULL      )] :Optional  :ConfigurationFile
  16     [-m[ode]             mode                (0         )] :Optional  :Mode
  17 >>> Matrix3D File Format y = Ax + b<<<
  18 a11 a21 a31 : Rotation Array : y=Ax
  19 a12 a22 a32
  20 a13 a23 a33
  21 b1  b2  b3  : Translation Array : y = x + b
  22 --- Attention ---
  23 If both options of -M and -EA are set,
  24     first, translation and rotation by -M will be performed
  25     then,  rotation by -EA will be done.
  26 </PRE>
  27 </BODY>
  28 </HTML>