include/Contour.h

   1 #ifndef CONTOUR_H
   2 #define CONTOUR_H
   3 /*
   4     contour.h
   5 */
   6 #include  "genUtil.h"
   7
   8 #ifndef MINFLOAT
   9 #define MINFLOAT (1e-31)
  10 #endif
  11
  12 #include "mrcImage.h"
  13 /* constant begin */
  14 #define CONTOUR_ACCURACY  (MINFLOAT)
  15 /* constant end */
  16
  17 /* struct begin */
  18 typedef long   contourParaTypeInteger;
  19 typedef double contourParaTypeReal;
  20
  21 typedef struct contourParaElement {
  22     contourParaTypeInteger n;
  23     contourParaTypeReal    Min;
  24     contourParaTypeReal    Max;
  25     contourParaTypeReal    d;
  26 } contourParaElement;
  27
  28 typedef struct contourImage {
  29     contourParaTypeReal* image;
  30     contourParaTypeReal* image2;
  31     contourParaElement   x;
  32     contourParaElement   y;
  33     contourParaElement   z;
  34     contourParaElement   w;
  35     contourParaElement   h;
  36     contourParaTypeReal  section;
  37 } contourImage;
  38
  39 typedef struct contourPoint {
  40     contourParaTypeReal    x;
  41     contourParaTypeReal    y;
  42     contourParaTypeReal    z;
  43 } contourPoint;
  44
  45 typedef struct contourALine contourALine;
  46 struct contourALine {
  47     contourALine* before;
  48     contourPoint p0;
  49     contourPoint p1;
  50     contourPoint p2;
  51     contourALine* next;
  52 };
  53
  54 typedef struct contourLine contourLine;
  55 struct contourLine {
  56     contourALine* top;
  57     contourALine* current;
  58     contourParaTypeInteger n;
  59     contourLine*  next;
  60 };
  61
  62 typedef struct contourLines contourLines;
  63 struct contourLines {
  64     contourLine*  top;
  65     contourLine*  current;
  66     contourParaTypeInteger n;
  67     contourLines* next;
  68 };
  69
  70 typedef struct contourLinesSet contourLinesSet;
  71 struct contourLinesSet {
  72     contourLines*  top;
  73     contourLines*  current;
  74     contourParaTypeInteger n;
  75     contourLinesSet* next;
  76 };
  77
  78 typedef struct contourArgs {
  79     contourParaTypeReal f00;  /* For 2D Contour*/
  80     contourParaTypeReal f01;
  81     contourParaTypeReal f11;
  82     contourParaTypeReal f10;
  83     contourParaTypeReal f000; /* For 3D Contour */
  84     contourParaTypeReal f001;
  85     contourParaTypeReal f010;
  86     contourParaTypeReal f011;
  87     contourParaTypeReal f100;
  88     contourParaTypeReal f101;
  89     contourParaTypeReal f110;
  90     contourParaTypeReal f111;
  91     contourParaTypeReal x;
  92     contourParaTypeReal y;
  93     contourParaTypeReal z;
  94     contourParaTypeReal dx;
  95     contourParaTypeReal dy;
  96     contourParaTypeReal dz;
  97 } contourArgs;
  98
  99 typedef enum contourFlag {
 100     contourFlagXSection,
 101     contourFlagYSection,
 102     contourFlagZSection,
 103     contourFlag3D
 104 } contourFlag;
 105 /* struct end */
 106
 107 /* prototype begin */
 108 /* search contour lines in a boxel */
 109 extern void createContourALine(contourLine* ls, contourArgs c);
 110
 111 /* create contour lines in order */
 112 extern void createContourLine (contourLines*  ls, contourLine* l);
 113
 114 /* craete contourLines at each section */
 115 extern void createContourLines(contourLines* ls, contourImage image);
 116
 117 /* create contourLines at all sections */
 118 extern void createContour(contourLinesSet* lsset, contourImage image, contourParaTypeReal level, contourFlag flag);
 119
 120 extern void appendContourLine0(contourLine* l, contourParaTypeReal xc1, contourParaTypeReal yc1, contourParaTypeReal xc2, contourParaTypeReal yc2, contourParaTypeReal z);
 121 extern void appendContourLine1(contourLine* l, contourLine* als);
 122
 123 extern void lmrc2contour(contourLinesSet* c, mrcImage* m, contourParaTypeReal l, contourFlag f, long mode);
 124 /* prototype end */
 125
 126 #endif /* CONTOUR_H */