include/lctfDetermination.h

   1 /*
   2 # %M% %Y% %I%
   3 # The latest update : %G% at %U%
   4 #
   5 #%Z% lctfDetermination ver %I%
   6 #%Z% Created by
   7 #%Z%
   8 #%Z% Usage : lctfDetermination
   9 #%Z% Attention
  10 #%Z%
  11 */
  12 #ifndef LCTF_DETERMINATION_H
  13 #define LCTF_DETERMINATION_H
  14
  15 #include "mrcImage.h"
  16 #include "ctfInfo.h"
  17
  18 typedef struct lctfDetermineInfo {
  19         ctfInfo initial;
  20
  21         long    ThonRing;
  22         /* For Astigmatism */
  23         int     flagAstigmatism;
  24         int    section;
  25
  26         int    degree;
  27         double step;
  28         double max;
  29         double min;
  30         float  firstRingDefocus;
  31         float  IntensityMin;
  32         float  IntensityMax;
  33         float* noise;
  34 } lctfDetermineInfo;
  35
  36
  37 /* prototype begin */
  38
  39 extern void lctfDetermine(ctfInfo* result, ctfInfo* var, mrcImage* mrc, lctfDetermineInfo* linfo, long mode);
  40 extern void lctfDtermmineUsage(FILE* fpt);
  41
  42 extern void lctfDeterminationbyMinMaxMethods(ctfInfo* res, mrcImage* mrc, ctfInfo* ini, long mode);
  43 extern void lctfDeterminationbyFittingMethods(ctfInfo* res, ctfInfo* var, mrcImage* mrc, ctfInfo* ini, long mode);
  44 extern void angularDistributionFunctionOfSignalAndNoise(float x, float p[], float* y, float dyda[], int na);
  45 extern void lctfDeterminationbyDifferentialMethods(ctfInfo* res, mrcImage* mrc, ctfInfo* ini,long* ThonRing, long mode);
  46 extern void lctfDeterminationbyCovarianceMethods(ctfInfo* res, mrcImage* mrc, ctfInfo* ini,long* ThonRing, long mode);
  47 extern void lctfDeterminationbyMixMethods(ctfInfo* res, mrcImage* mrc, ctfInfo* ini, long* ThonRing,long mode);
  48 extern void lctfDeterminationbyMinSquareMethods(ctfInfo* res, mrcImage* mrc, ctfInfo* ini,long* ThonRing,lctfDetermineInfo* linfo,floatVector* defocus,floatVector* Eres ,long mode);
  49 extern void lctfDeterminationbyMinSquareMethodsWithAcomp(ctfInfo* res, mrcImage* mrc, ctfInfo* ini,long* ThonRing,lctfDetermineInfo* linfo,floatVector* defocus,floatVector* Eres ,long mode);
  50 extern double lctfDeterminationByTangent(ctfInfo* res, mrcImage* mrc, ctfInfo* ini,lctfDetermineInfo* linfo,floatVector* defocus,floatVector* Eres, long mode);
  51 extern void EnvelopeDetermine(ctfInfo* res, mrcImage* mrc, ctfInfo* ini,lctfDetermineInfo* linfo,floatVector* defocus,floatVector* Eres, long mode);
  52 /* prototype end */
  53
  54 #endif /* LCTF_DETERMINATION_H */
  55