include/lllExtract.h

   1 #ifndef LLL_EXTRACT_INFO_H
   2 #define LLL_EXTRACT_INFO_H
   3 /*
   4 # %M% %Y% %I%
   5 # The latest update : %G% at %U%
   6 #
   7 #%Z% lllExtract.h ver %I%
   8 #%Z% Created by
   9 #%Z%
  10 #%Z% Usage : lllExtract.h
  11 #%Z% Attention
  12 #%Z%
  13 */
  14
  15 #include "mrcImage.h"
  16 #include "llData.h"
  17 #include "lllDataFit.h"
  18 #include "lllDatarMaxLimit.h"
  19
  20 /* struct begin */
  21 typedef struct lllExtractInfo {
  22     char* Title;
  23     float xStep;
  24     float yStep;
  25     float MaxX;
  26     float MaxY;
  27     float RotationAngle;
  28     float Omega;
  29     float Shear;
  30     long ievery;
  31     float axl;
  32     float ayl;
  33     float xShift;
  34     long llMax;
  35     llDataParaTypeReal delRInv; /* [A] */
  36     long flagOutputInfo; /* for Compati */
  37     long* n;
  38     long* nn;   /* number of diffenent n along l*/
  39     long** ns;  /* diffenent n's along l*/
  40     long* l;
  41     float* Y;
  42     float* leftMin;
  43     float* leftMax;
  44     float* rightMin;
  45     float* rightMax;
  46     float* weight;
  47         llDataParaTypeReal truePitch;
  48         lllDatarMaxLimitInfo rMax;
  49         llDataParaTypeReal   RMax;
  50         llDataParaTypeReal RMaxFirst;
  51
  52         int flagMagnitudeLimit;
  53 } lllExtractInfo;
  54 /* struct end */
  55
  56 #ifdef __cplusplus
  57 extern "C" {
  58 #endif
  59 /* prototype begin */
  60
  61 /* in lllExtract.c */
  62 extern void lllExtract(llData* nea, llData* far, mrcImage* in, lllExtractInfo* info);
  63
  64
  65 extern void lllExtractWithSeparationUsingFittingParameter(llData* dst, llDataBoth* src,
  66                 llDataFittedParam* param,
  67                 int number,
  68                 lllExtractInfo* info,
  69                 int mode);
  70
  71 extern void lllExtractWithSeparation(llDataBoth* dst, llDataBoth* src,
  72                 lllExtractInfo* info, int mode);
  73 extern void lllExtractWithWeightedSeparation(llDataBoth* dst, llDataBoth* src,
  74                 llData* weight, lllExtractInfo* info, int mode);
  75
  76 extern void lllDatarMaxLimitForSeparation(llData* ll, float rMax,
  77                 lllExtractInfo* linfo, long mode);
  78
  79 extern void lllDataSeparationInfoRead(lllExtractInfo* linfo, mrcImage* mrc, FILE* fpt);
  80 extern void lllDataSeparationInfoFileFormat(FILE* fpt);
  81
  82
  83 extern void lllDataSeparationInfoTruePitchSet(lllExtractInfo* linfo, llDataParaTypeReal truePitch);
  84 extern void lllDataSeparationInfoDelRInvSet(lllExtractInfo* linfo, llDataParaTypeReal DelRInv);
  85 extern void lllDataSeparationInfoxShiftSet(lllExtractInfo* linfo, llDataParaTypeReal xShift);
  86 extern void lllExtractWeightSetFollowingllExtractInfo(llData* dst, lllExtractInfo* info, float weight, int mode);
  87 /* prototype end */
  88
  89 #ifdef __cplusplus
  90 };
  91 #endif
  92
  93 #endif