src/Objects/DataManip/emData/doc/emData.html

   1 <H4> Update Time 06/11/13---21:22:21 </H4>
   2 <HR>
   3 <A NAME="Information">
   4 <H2>Information from source codes</H2>
   5 </A>
   6 <PRE>
   7 ../src/emDataRead.c:
   8 </PRE>
   9 <HR>
  10 <A NAME="include">
  11 <H2>emData.h</H2>
  12 </A>
  13 <PRE>
  14 #ifndef EMDATA_H
  15 #define EMDATA_H
  16
  17 #include <stdio.h>
  18
  19 /* constant begin */
  20 #define EMDATA_VER0_HEADER_SIZE (256)
  21 #define EMDATA_HEADER_SIZE (512)
  22 /* constant end */
  23
  24 /* struct begin */
  25 typedef char  emDataTypeChar;
  26 typedef short emDataTypeIntegerShort;
  27 typedef int   emDataTypeInteger;
  28 typedef float emDataTypeFloat;
  29
  30 typedef struct emDataHeaderCont {
  31         /* 1st 256 byte                                        :256 */
  32         emDataTypeIntegerShort type1;                           /* 000-001 :  2 */
  33         emDataTypeIntegerShort type2;                       /* 002-003 :  2 */
  34         emDataTypeInteger      Nx;                                  /* 004-007 :  4 */
  35         emDataTypeInteger      Ny;                                      /* 010-013 :  4 */
  36         emDataTypeInteger      Nz;                                      /* 014-017 :  4 */
  37         emDataTypeChar         Comment[96];                 /* 020-137 : 96 */
  38         emDataTypeFloat        unknown[36];                 /* 140-377 :144 */
  39         /* 2nd 256 byte                                         256*/
  40         emDataTypeChar         ExtendedCode[4];         /* 400-403 :  4 : wwww */
  41         emDataTypeFloat        kV;                          /* 404-407 :  4 */
  42         emDataTypeFloat        Cs;                          /* 410-413 :  4 */
  43         emDataTypeFloat        UnknownFloat413;         /* 413-417 :  4 : 0    */
  44         emDataTypeFloat        Magnification;       /* 420-423 :  4 */
  45         emDataTypeFloat        PostMagnification;   /* 424-427 :  4 */
  46         emDataTypeFloat        Cc;                  /* 430-433 :  4 */
  47         emDataTypeFloat        Defocus;             /* 433-437 :  4 */
  48         emDataTypeFloat        UnknownFloat440[8];  /* 440-477 : 32 */
  49         emDataTypeFloat        UnknownFloat500[5];  /* 500-523 : 20 */
  50         emDataTypeFloat        ccdSize;             /* 524-527 :  4 */
  51         emDataTypeFloat        offsetX;             /* 530-533 :  4 */
  52         emDataTypeFloat        offsetY;             /* 534-537 :  4 */
  53         emDataTypeFloat        pixelSize;           /* 540-543 :  4 */
  54         emDataTypeFloat        binning;             /* 543-547 :  4 */
  55         emDataTypeFloat        readOutSpeed;        /* 550-553 :  4 */
  56         emDataTypeFloat        gain;                /* 554-557 :  4 */
  57         emDataTypeFloat        sensitivity;         /* 560-563 :  4 */
  58         emDataTypeFloat        time;                /* 564-567 :  4 */
  59         emDataTypeFloat        flatField;           /* 570-573 :  4 */
  60         emDataTypeFloat        UnknownFloat574;     /* 574-577 :  4 */
  61         emDataTypeFloat        average;             /* 600-603 :  4 */
  62         emDataTypeFloat        unknown604;          /* 604-607 :  4 */
  63         emDataTypeFloat        unknown610;          /* 610-613 :  4 : 0 */
  64         emDataTypeFloat        unknown613;          /* 614-617 :  4 : 0 */
  65         emDataTypeFloat        unknown620;          /* 620-623 :  4 : 1e4*/
  66         emDataTypeFloat        unknown623;          /* 624-627 :  4 : 7e6*/
  67         emDataTypeFloat        min;                 /* 630-633 :  4 */
  68         emDataTypeFloat        max;                 /* 634-637 :  4 */
  69         emDataTypeFloat        StatisticQuality;    /* 640-643 :  4 */
  70         emDataTypeFloat        UnknownFloat644[23]; /* 644-777 :   */
  71 } emDataHeaderCont;
  72
  73 typedef union emDataHeader {
  74         char  All[512];
  75         float Float[128];
  76         int   Int[128];
  77         emDataHeaderCont Cont;
  78 } emDataHeader;
  79
  80 typedef struct emData {
  81         emDataHeader Header;
  82         int          version;
  83         unsigned char*          Image;
  84         emDataTypeIntegerShort* ShortImage;
  85 } emData;
  86
  87 /* struct end */
  88
  89 /* prototpye begin */
  90 extern void emDataHeaderRead(emData* em, FILE* fpt, char* message, int mode);
  91 extern void emDataFileRead(emData* em, FILE* fpt, char* message, int mode);
  92 extern void emDataHeaderPrint(emData* em, FILE* fpt, char* message, int mode);
  93 /* prototype end */
  94
  95 #endif /* EMDATA_H */
  96
  97 </PRE>