src/Tools/mrcImage/mrcImageInfo/src/mrcImageInfo.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>mrcImageInfo</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>mrcImageInfo</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: mrcImageInfo
  10 Options:
  11     [-i[nput]            In                  (NULL      )] :Essential :InputDataFile
  12     [-o[utput]           Out                 (stdout    )] :Optional  :OutputDataFile
  13     [-X[Section]         X                   (0.0       )] :Optional  :X Section at y=X(value)
  14     [-Y[Section]         Y                   (0.0       )] :Optional  :Y Section at y=Y(value)
  15     [-x[Projection]      ] :Optional  :x Projection[OutPut ASCII FILE]
  16     [-y[Projection]      ] :Optional  :y Projection[OutPut ASCII FILE]
  17     [-H[istgram]         H                   (256       )] :Optional  :Histgram: Class Number: Normalize
  18     [-H[istgram]2        H2                  (1         )] :Optional  :Histgram2: Class Width: Integer: Normalize
  19     [-H[istgram]3        H3                  (256       )] :Optional  :Histgram: Class Number: Count
  20     [-H[istgram]4        H4                  (1         )] :Optional  :Histgram2: Class Width: Integer: Count
  21     [-H[istgram]5        H5                  (1         )] :Optional  :Histgram5: Class Number: Count
  22     [-H[istgram]6        H6                  (1         )] :Optional  :Histgram6: Class Width: Integer: Count
  23     [-Low                Low                 (1         )] :Optional  :Low : thres
  24     [-High               High                (1         )] :Optional  :High: thres
  25     [-I[nfo]             ] :Optional  :Information
  26     [-c[onfig]           configFile          (NULL      )] :Optional  :ConfigurationFile
  27     [-rmax               rmax                (250       )] :Optional  :rmax [A]
  28     [-m[ode]             mode                (0         )] :Optional  :Mode
  29 ----- Additional Usage -----
  30 The -I option uses -rmax or -m options
  31 -m 0: mean of all density
  32    1: mean of sphere surface density at rmax
  33    2: mean of cylinder surface density at rmax
  34    3: mean of edge pixels
  35 </PRE>
  36 </BODY>
  37 </HTML>