src/Tools/mrcImage/mrcImageParticleCandidateExtract/src/init.c

   1 #include <stdio.h>
   2 #include <stdlib.h>
   3 #include <string.h>
   4 #include <math.h>
   5 #include "../inc/config.h"
   6 #include "genUtil.h"
   7 #include "String.h"
   8 #include "File.h"
   9 #include "Memory.h"
  10
  11
  12 void
  13 init0(mrcImageParticleCandidateExtractInfo* info)
  14 {
  15     info->fptIn = NULL;    info->flagIn = 0;
  16     info->fptOut = NULL;    info->flagOut = 0;
  17     info->RingRadius = 100.0;    info->flagRingRadius = 0;
  18     info->RingWidth = 10.0;    info->flagRingWidth = 0;
  19     info->Threshold = 3.0;    info->flagThreshold = 0;
  20     info->fptoutFileThres = stdout;    info->flagoutFileThres = 0;
  21     info->fptconfigFile = NULL;    info->flagconfigFile = 0;
  22     info->mode = 0;    info->flagmode = 0;
  23 }
  24
  25 void
  26 init1(mrcImageParticleCandidateExtractInfo* info)
  27 {
  28     char s[1024];
  29     int i;
  30     if(!info->flagIn) {
  31         stringGetFromFile(s, "In", stdin, stdout, 0);
  32         info->In = stringGetNthWord(s, 1, " ,\t");
  33         info->flagIn++;
  34     }
  35     if(info->flagIn) {
  36         info->fptIn = fileOpen(info->In, "r");
  37     }
  38
  39     if(!info->flagOut) {
  40         stringGetFromFile(s, "Out", stdin, stdout, 0);
  41         info->Out = stringGetNthWord(s, 1, " ,\t");
  42         info->flagOut++;
  43     }
  44     if(info->flagOut) {
  45         info->fptOut = fileOpen(info->Out, "w");
  46     }
  47
  48     if(info->flagRingRadius) {
  49     }
  50
  51     if(info->flagRingWidth) {
  52     }
  53
  54     if(info->flagThreshold) {
  55     }
  56
  57     if(info->flagoutFileThres) {
  58         info->fptoutFileThres = fileOpen(info->outFileThres, "w");
  59     }
  60
  61     if(info->flagconfigFile) {
  62         info->fptconfigFile = fileOpen(info->configFile, "r");
  63     }
  64
  65     if(info->flagmode) {
  66     }
  67
  68 }
  69 #ifdef KHOROS
  70 #include <stdio.h>
  71 #include "bootstrap.h"
  72 #include "dataserv.h"
  73 #include "datamanip.h"
  74 extern void func_usage_additions(void);
  75 extern void func_free_args(kexit_status status, kaddr client_data);
  76 extern void func_get_args(kform* pane);
  77
  78 void
  79 func_usage_additions(void)
  80 {
  81 }
  82 void
  83 func_free_args(kexit_status status, kaddr client_data)
  84 {
  85 }
  86 void
  87 func_get_args(kform* pane)
  88 {
  89 }
  90 void
  91 khorosInit(int argc, char* argv[])
  92 {
  93     char* eospath;
  94     char  panepath[1024];
  95     FILE* fpt;
  96
  97     eospath = getenv("EOS_HOME");
  98     sprintf(panepath, "%s/src/Tools/mrcImage/mrcImageParticleCandidateExtract/src/mrcImageParticleCandidateExtract.pane", eospath);
  99     khoros_initialize(argc, argv, "EOS");
 100     fpt = fopen(panepath, "r");    if(NULL!=fpt) {
 101         fclose(fpt);
 102         kclui_initialize(panepath, KGEN_NONE, "EOS", "mrcImageParticleCandidateExtract",
 103                      func_usage_additions,
 104                      func_get_args,
 105                      func_free_args);
 106     }
 107 }
 108 #endif /* KHOROS */