src/Tools/mrcImage/mrcImageShapeSearch/inc/mrcImageShapeSearch.h

   1 #ifndef MRCIMAGESHAPESEARCH_H
   2 #define MRCIMAGESHAPESEARCH_H
   3 #include <stdio.h>
   4 #include <stdlib.h>
   5
   6 #define OPTION_FLAG     '-'
   7 #define OPTION_FLAG_POS (0)
   8 #define OPTION_POS      (1)
   9
  10
  11
  12
  13 typedef struct mrcImageShapeSearchInfo {
  14     long flagRedirect;
  15
  16     long flagIn;
  17     char* In;
  18     FILE* fptIn;
  19
  20     long flagOut;
  21     char* Out;
  22     FILE* fptOut;
  23
  24     long flagShape;
  25     char* Shape;
  26     FILE* fptShape;
  27
  28     long flagminR;
  29     long minR;
  30
  31     long flagmaxR;
  32     long maxR;
  33
  34     long flagdelR;
  35     long delR;
  36
  37     long flagminL;
  38     long minL;
  39
  40     long flagmaxL;
  41     long maxL;
  42
  43     long flagdelL;
  44     long delL;
  45
  46     long flagminPhi;
  47     float minPhi;
  48
  49     long flagmaxPhi;
  50     float maxPhi;
  51
  52     long flagdelPhi;
  53     float delPhi;
  54
  55     long flagminTheta;
  56     float minTheta;
  57
  58     long flagmaxTheta;
  59     float maxTheta;
  60
  61     long flagdelTheta;
  62     float delTheta;
  63
  64     long flagminPsi;
  65     float minPsi;
  66
  67     long flagmaxPsi;
  68     float maxPsi;
  69
  70     long flagdelPsi;
  71     float delPsi;
  72
  73     long flagthresZscore;
  74     float thresZscore;
  75
  76     long flaginterpMode;
  77     long interpMode;
  78
  79     long flagconfigFile;
  80     char* configFile;
  81     FILE* fptconfigFile;
  82
  83     long flagmode;
  84     long mode;
  85
  86 } mrcImageShapeSearchInfo;
  87 #ifdef __cplusplus
  88 extern "C" {
  89 #endif
  90 extern void argCheck(mrcImageShapeSearchInfo* info, int argc, char* avgv[]);
  91 extern void khorosInit(int argc, char* avgv[]);
  92 extern void init0(mrcImageShapeSearchInfo* info);
  93 extern void init1(mrcImageShapeSearchInfo* info);
  94 extern void usage(char* usage);
  95 extern void additionalUsage(void);
  96 extern void htmlBeforeUsage(char* usage);
  97 extern void htmlAfterUsage(char* usage);
  98 #ifdef __cplusplus
  99 };
 100 #endif
 101 #endif /* MRCIMAGESHAPESEARCH_H */