src/Tools/rec3d/mrcImageOrientationSearchByHybridization/src/mrcImageOrientationSearchByHybridization.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>mrcImageOrientationSearchByHybridization</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>mrcImageOrientationSearchByHybridization</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: mrcImageOrientationSearchByHybridization
  10 Options:
  11     [-I[nputFileLiest]   In                  (NULL      )] :Essential :InputDataFileList
  12     [-o[utput]           Out                 (NULL      )] :Essential :OutputDataFileHeader
  13     [-e[xtension]        extension           (NULL      )] :Essential :OutputDataFileExtension
  14     [-c[onfig]           configFile          (NULL      )] :Optional  :ConfigurationFile
  15     [-m[ode]             mode                (0         )] :Optional  :Mode
  16     [-i[ncrease]r[ate]   ir                  (1         )] :Optional  :IncreaseRate
  17     [-h[ybridization]p[oint]n[umber]hpn                 (1         )] :Optional  :HybridizationPointNumber
  18     [-m[ode]s[election]  ms                  (0         )] :Optional  :ModeOfSelection
  19     [-i[nitial]r[andom]d[ata]ird                 (0         )] :Optional  :InitialRandomData
  20
  21 >> This algrithm use results of mrcImageOrientationSearchBySimultaneousMinimization
  22
  23 ----- IncreaseRate -----
  24 -ir : 1 >> Increase number is 45 (filenum = 10)
  25       2 >> Increase number is 90 (filenum = 10)
  26
  27 ----- HybridizationPointNumber -----
  28 -hpn : The number of hybridization points
  29
  30 ----- Mode of selection -----
  31 -ms : 0 : random
  32       1 : myself (-ird)
  33
  34 ----- Mode -----
  35 -m : 0 : create children angle file
  36      1 : do not create children angle file , create match angle file
  37
  38 </PRE>
  39 </BODY>
  40 </HTML>