OSDN Git Service

Modify Makefile for util/src
[eos/base.git] / src / Tools / pdbUtil / pdbCrystalCreate / src / pdbCrystalCreate.html
index c37d61a..24999d3 100755 (executable)
@@ -1 +1,36 @@
-/bin/bash: pdbCrystalCreate: そのようなファイルやディレクトリはありません
+<HTML>
+<HEAD>
+<TITLE>pdbCrystalCreate</TITLE>
+</HEAD>
+<BODY>
+<H1>pdbCrystalCreate</H1>
+<H2>Usage</H2>
+<PRE>
+Usage: pdbCrystalCreate
+Options:
+    [-i[nput]            In                  (NULL      ).as(inFile              ) ] :Essential :Input:PDB
+    [-I[nfo]             Info                (NULL      ).as(inFile              ) ] :Essential :Input:Crystal Information
+    [-o[utput]           Out                 (NULL      ).as(outFile             ) ] :Essential :Output:PDB
+    [-c[onfig]           configFile          (NULL      ).as(inFile              ) ] :Optional  :ConfigurationFile
+    [-m[ode]             mode                (0         ).as(Integer             ) ] :Optional  :Mode
+----- Additional Usage -----
+----- CrystalInfo -----
+aAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
+bAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
+cAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
+CellLength  %15.6g %15.6g %15.6g
+Origin      %15.6g %15.6g %15.6g
+N           %15d %15d %15d
+StartN      %15d %15d %15d
+SpaceGroup  %15d
+HelixInfo   %10d %10d %10d
+### Attention ###
+Parameter Order is important: Dependent between CellLength and a|b|cAxis.
+                              Because each of aAxis, bAxis, cAxis must be a unit vector.
+HelixInfo   t  u  n
+----- CrystalSpaceGroup -----
+    0 P1
+    1 HelicalSymmmetry
+</PRE>
+</BODY>
+</HTML>