Merge branch 'jk/add-p-commentchar-fix' into maint

"git add -p" were updated in 2.12 timeframe to cope with custom
core.commentchar but the implementation was buggy and a
metacharacter like $ and * did not work.

* jk/add-p-commentchar-fix:
  add--interactive: quote commentChar regex
  add--interactive: handle EOF in prompt_yesno

Merge branch 'js/alias-early-config' into maint

The code to pick up and execute command alias definition from the
configuration used to switch to the top of the working tree and
then come back when the expanded alias was executed, which was
unnecessarilyl complex.  Attempt to simplify the logic by using the
early-config mechanism that does not chdir around.

* js/alias-early-config:
  alias: use the early config machinery to expand aliases
  t7006: demonstrate a problem with aliases in subdirectories
  t1308: relax the test verifying that empty alias values are disallowed
  help: use early config when autocorrecting aliases
  config: report correct line number upon error
  discover_git_directory(): avoid setting invalid git_dir

Merge branch 'rs/pretty-add-again' into maint

The pretty-format specifiers like '%h', '%t', etc. had an
optimization that no longer works correctly.  In preparation/hope
of getting it correctly implemented, first discard the optimization
that is broken.

* rs/pretty-add-again:
  pretty: recalculate duplicate short hashes

Merge branch 'ah/doc-gitattributes-empty-index' into maint

An example in documentation that does not work in multi worktree
configuration has been corrected.

* ah/doc-gitattributes-empty-index:
  doc: do not use `rm .git/index` when normalizing line endings

Merge branch 'da/mergetools-meld-output-opt-on-macos' into maint

"git mergetool" learned to work around a wrapper MacOS X adds
around underlying meld.

* da/mergetools-meld-output-opt-on-macos:
  mergetools/meld: improve compatibiilty with Meld on macOS X

Merge branch 'jk/diff-highlight-module' into maint

The 'diff-highlight' program (in contrib/) has been restructured
for easier reuse by an external project 'diff-so-fancy'.

* jk/diff-highlight-module:
  diff-highlight: split code into module

l10n: de.po: fix typo

Reported-by: Andre Hinrichs <andre.hinrichs@gmx.de>
Signed-off-by: Ralf Thielow <ralf.thielow@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Git 2.13.2

Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'sn/reset-doc-typofix' into maint

Doc update.

* sn/reset-doc-typofix:
  doc: git-reset: fix a trivial typo

Merge branch 'sg/doc-pretty-formats' into maint

Doc update.

* sg/doc-pretty-formats:
  docs/pretty-formats: stress that %- removes all preceding line-feeds

Merge branch 'sd/t3200-branch-m-test' into maint

New test.

* sd/t3200-branch-m-test:
  t3200: add test for single parameter passed to -m option

Merge branch 'sg/revision-parser-skip-prefix' into maint

Code clean-up.

* sg/revision-parser-skip-prefix:
  revision.c: use skip_prefix() in handle_revision_pseudo_opt()
  revision.c: use skip_prefix() in handle_revision_opt()
  revision.c: stricter parsing of '--early-output'
  revision.c: stricter parsing of '--no-{min,max}-parents'
  revision.h: turn rev_info.early_output back into an unsigned int

Merge branch 'km/test-mailinfo-b-failure' into maint

New tests.

* km/test-mailinfo-b-failure:
  t5100: add some more mailinfo tests

Merge branch 'sb/submodule-rm-absorb' into maint

Doc update to a recently graduated topic.

* sb/submodule-rm-absorb:
  Documentation/git-rm: correct submodule description

Merge branch 'jc/diff-tree-stale-comment' into maint

Comment fix.

* jc/diff-tree-stale-comment:
  diff-tree: update stale in-code comments

Merge branch 'ps/stash-push-pathspec-fix' into maint

"git stash push <pathspec>" did not work from a subdirectory at all.
Bugfix for a topic in v2.13

* ps/stash-push-pathspec-fix:
  git-stash: fix pushing stash with pathspec from subdir

Merge branch 'ls/github' into maint

Help contributors that visit us at GitHub.

* ls/github:
  Configure Git contribution guidelines for github.com

Merge branch 'jk/pack-idx-corruption-safety' into maint

A flaky test has been corrected.

* jk/pack-idx-corruption-safety:
  t5313: make extended-table test more deterministic

Merge branch 'jk/diff-blob' into maint

The result from "git diff" that compares two blobs, e.g. "git diff
$commit1:$path $commit2:$path", used to be shown with the full
object name as given on the command line, but it is more natural to
use the $path in the output and use it to look up .gitattributes.

* jk/diff-blob:
  diff: use blob path for blob/file diffs
  diff: use pending "path" if it is available
  diff: use the word "path" instead of "name" for blobs
  diff: pass whole pending entry in blobinfo
  handle_revision_arg: record paths for pending objects
  handle_revision_arg: record modes for "a..b" endpoints
  t4063: add tests of direct blob diffs
  get_sha1_with_context: dynamically allocate oc->path
  get_sha1_with_context: always initialize oc->symlink_path
  sha1_name: consistently refer to object_context as "oc"
  handle_revision_arg: add handle_dotdot() helper
  handle_revision_arg: hoist ".." check out of range parsing
  handle_revision_arg: stop using "dotdot" as a generic pointer
  handle_revision_arg: simplify commit reference lookups
  handle_revision_arg: reset "dotdot" consistently

Merge branch 'jc/name-rev-lw-tag' into maint

"git describe --contains" penalized light-weight tags so much that
they were almost never considered.  Instead, give them about the
same chance to be considered as an annotated tag that is the same
age as the underlying commit would.

* jc/name-rev-lw-tag:
  name-rev: favor describing with tags and use committer date to tiebreak
  name-rev: refactor logic to see if a new candidate is a better name

add--interactive: quote commentChar regex

Since c9d961647 (i18n: add--interactive: mark
edit_hunk_manually message for translation, 2016-12-14),
when the user asks to edit a hunk manually, we respect
core.commentChar in generating the edit instructions.
However, when we then strip out comment lines, we use a
simple regex like:

  /^$commentChar/

If your chosen comment character is a regex metacharacter,
then that will behave in a confusing manner ("$", for
instance, would only eliminate blank lines, not actual
comment lines).

We can fix that by telling perl not to respect
metacharacters.

Reported-by: Christian Rösch <christian@croesch.de>
Signed-off-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

add--interactive: handle EOF in prompt_yesno

The prompt_yesno function loops indefinitely waiting for a
"y" or "n" response. But it doesn't handle EOF, meaning
that we can end up in an infinite loop of reading EOF from
stdin. One way to simulate that is with:

  echo e | GIT_EDITOR='echo corrupt >' git add -p

Let's break out of the loop and propagate the undef to the
caller. Without modifying the callers that effectively turns
it into a "no" response. This is reasonable for both of the
current callers, and it leaves room for any future caller to
check for undef explicitly.

Signed-off-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

mergetools/meld: improve compatibiilty with Meld on macOS X

The macOS X fork of Meld[1] requires a "=" in the "--output"
argument, as it uses a wrapper[2] script that munges the
"--output" argument before calling into the common "meld"
script.

The macOS X wrapper script[2] accepts "--output=<filename>"
only, despite the fact that the underlying meld code accepts
both "--output <filename" and "--output=<filename>"[3].

All versions of meld which accept "--output" accept it in
the "--output=<filename>" form, so use "--output=<file>" for
maximum compatibility.

[1] https://github.com/yousseb/meld
[2] https://github.com/yousseb/meld/blob/master/osx/Meld
[3] https://github.com/yousseb/meld/issues/42

Reported-by: Matthew Groth <mgroth49@gmail.com>
Helped-by: Samuel Lijin <sxlijin@gmail.com>
Signed-off-by: David Aguilar <davvid@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

docs/pretty-formats: stress that %- removes all preceding line-feeds

Signed-off-by: SZEDER Gábor <szeder.dev@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

doc: git-reset: fix a trivial typo

Signed-off-by: Štěpán Němec <stepnem@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

alias: use the early config machinery to expand aliases

Instead of discovering the .git/ directory, reading the config and then
trying to painstakingly reset all the global state if we did not find a
matching alias, let's use the early config machinery instead.

It may look like unnecessary work to discover the .git/ directory in the
early config machinery and then call setup_git_directory_gently() in the
case of a shell alias, repeating the very same discovery *again*.
However, we have to do this as the early config machinery takes pains
*not* to touch any global state, while shell aliases expect a possibly
changed working directory and at least the GIT_PREFIX and GIT_DIR
variables to be set.

This change also fixes a known issue where Git tried to read the pager
config from an incorrect path in a subdirectory of a Git worktree if an
alias expanded to a shell command.

Signed-off-by: Johannes Schindelin <johannes.schindelin@gmx.de>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

t7006: demonstrate a problem with aliases in subdirectories

When expanding aliases, the git_dir is set during the alias expansion
(by virtue of running setup_git_directory_gently()).

This git_dir may be relative to the current working directory, and
indeed often is simply ".git/".

When the alias expands to a shell command, we restore the original
working directory, though, yet we do not reset git_dir.

As a consequence, subsequent read_early_config() runs will mistake the
git_dir to be populated properly and not find the correct config.

Demonstrate this problem by adding a test case.

Signed-off-by: Johannes Schindelin <johannes.schindelin@gmx.de>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

t1308: relax the test verifying that empty alias values are disallowed

We are about to change the way aliases are expanded, to use the early
config machinery.

This machinery reports errors in a slightly different manner than the
cached config machinery.

Let's not get hung up by the precise wording of the message mentioning
the line number. It is really sufficient to verify that all the relevant
information is given to the user.

Signed-off-by: Johannes Schindelin <johannes.schindelin@gmx.de>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

help: use early config when autocorrecting aliases

Git has this feature which suggests similar commands (including aliases)
in case the user specified an unknown command.

This feature currently relies on a side effect of the way we expand
aliases right now: when a command is not a builtin, we use the regular
config machinery (meaning: discovering the .git/ directory and
initializing global state such as the config cache) to see whether the
command refers to an alias.

However, we will change the way aliases are expanded in the next
commits, to use the early config instead. That means that the
autocorrect feature can no longer discover the available aliases by
looking at the config cache (because it has not yet been initialized).

So let's just use the early config machinery instead.

This is slightly less performant than the previous way, as the early
config is used *twice*: once to see whether the command refers to an
alias, and then to see what aliases are most similar. However, this is
hardly a performance-critical code path, so performance is less important
here.

Signed-off-by: Johannes Schindelin <johannes.schindelin@gmx.de>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

config: report correct line number upon error

When get_value() parses a key/value pair, it is possible that the line
number is decreased (because the \n has been consumed already) before the
key/value pair is passed to the callback function, to allow for the
correct line to be attributed in case of an error.

However, when git_parse_source() asks get_value() to parse the key/value
pair, the error reporting is performed *after* get_value() returns.

Which means that we have to be careful not to increase the line number
in get_value() after the callback function returned an error.

Signed-off-by: Johannes Schindelin <johannes.schindelin@gmx.de>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

discover_git_directory(): avoid setting invalid git_dir

When discovering a .git/ directory, we take pains to ensure that its
repository format version matches Git's expectations, and we return NULL
otherwise.

However, we still appended the invalid path to the strbuf passed as
argument.

Let's just reset the strbuf to the state before we appended the .git/
directory that was eventually rejected.

There is another early return path in that function, when
setup_git_directory_gently_1() returns GIT_DIR_NONE or an error. In that
case, the gitdir parameter has not been touched, therefore there is no
need for an equivalent change in that code path.

Signed-off-by: Johannes Schindelin <johannes.schindelin@gmx.de>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

diff-highlight: split code into module

The diff-so-fancy project is also written in perl, and most
of its users pipe diffs through both diff-highlight and
diff-so-fancy. It would be nice if this could be done in a
single script. So let's pull most of diff-highlight's code
into its own module which can be used by diff-so-fancy.

In addition, we'll abstract a few basic items like reading
from stdio so that a script using the module can do more
processing before or after diff-highlight handles the lines.
See the README update for more details.

One small downside is that the diff-highlight script must
now be built using the Makefile. There are ways around this,
but it quickly gets into perl arcana. Let's go with the
simple solution. As a bonus, our Makefile now respects the
PERL_PATH variable if it is set.

Signed-off-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

pretty: recalculate duplicate short hashes

b9c6232138 (--format=pretty: avoid calculating expensive expansions
twice) optimized adding short hashes multiple times by using the
fact that the output strbuf was only ever simply appended to and
copying the added string from the previous run.  That prerequisite
is no longer given; we now have modfiers like %< and %+ that can
cause the cache to lose track of the correct offsets.  Remove it.

Reported-by: Michael Giuffrida <michaelpg@chromium.org>
Signed-off-by: Rene Scharfe <l.s.r@web.de>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

doc: do not use `rm .git/index` when normalizing line endings

When illustrating how to normalize the line endings, the
documentation in gitattributes tells the user to `rm .git/index`.

This is incorrect for two reasons:

 - Users shouldn't be instructed to mess around with the internal
   implementation of Git using raw file system tools like `rm`.

 - Within a submodule or an additional working tree `.git` is just a
   file containing a `gitdir: <path>` pointer into the real `.git`
   directory.  Therefore `rm .git/index` does not work.

The purpose of the `rm .git/index` instruction is to remove all entries
from the index without touching the working tree.  The way to do this
with Git is to use `read-tree --empty`.

Signed-off-by: Andreas Heiduk <asheiduk@gmail.com>
Helped-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>
Helped-by: Torsten Bögershausen <tboegi@web.de>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Prepare for 2.13.2

Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'ad/pull-remote-doc' into maint

Docfix.

* ad/pull-remote-doc:
  docs: fix formatting and grammar

Merge branch 'jk/drop-free-refspecs' into maint

Code clean-up.

* jk/drop-free-refspecs:
  remote: drop free_refspecs() function

Merge branch 'jk/connect-symref-info-leak-fix' into maint

Leakfix.

* jk/connect-symref-info-leak-fix:
  connect.c: fix leak in parse_one_symref_info()

Merge branch 'rf/completion-config-commit' into maint

Completion update.

* rf/completion-config-commit:
  completion: add completions for git config commit

Merge branch 'ab/t3070-test-dedup' into maint

Test cleanup.

* ab/t3070-test-dedup:
  wildmatch test: remove redundant duplicate test

Merge branch 'jh/memihash-opt' into maint

perf-test update.

* jh/memihash-opt:
  p0004: don't error out if test repo is too small
  p0004: don't abort if multi-threaded is too slow
  p0004: use test_perf
  p0004: avoid using pipes
  p0004: simplify calls of test-lazy-init-name-hash

Merge branch 'tb/pull-ff-rebase-autostash' into maint

"git pull --rebase --autostash" didn't auto-stash when the local history
fast-forwards to the upstream.

* tb/pull-ff-rebase-autostash:
  pull: ff --rebase --autostash works in dirty repo

Merge branch 'jh/close-index-before-stat' into maint

The timestamp of the index file is now taken after the file is
closed, to help Windows, on which a stale timestamp is reported by
fstat() on a file that is opened for writing and data was written
but not yet closed.

* jh/close-index-before-stat:
  read-cache: close index.lock in do_write_index

Merge branch 'sl/clean-d-ignored-fix' into maint

"git clean -d" used to clean directories that has ignored files,
even though the command should not lose ignored ones without "-x".
"git status --ignored"  did not list ignored and untracked files
without "-uall".  These have been corrected.

* sl/clean-d-ignored-fix:
  clean: teach clean -d to preserve ignored paths
  dir: expose cmp_name() and check_contains()
  dir: hide untracked contents of untracked dirs
  dir: recurse into untracked dirs for ignored files
  t7061: status --ignored should search untracked dirs
  t7300: clean -d should skip dirs with ignored files

Merge branch 'dk/send-email-avoid-net-smtp-ssl-when-able' into maint

A hotfix to a topic in 'master'.

* dk/send-email-avoid-net-smtp-ssl-when-able:
  send-email: Net::SMTP::starttls was introduced in v2.34
  send-email: Net::SMTP::SSL is obsolete, use only when necessary

Merge branch 'jc/skip-test-in-the-middle' into maint

A recent update to t5545-push-options.sh started skipping all the
tests in the script when a web server testing is disabled or
unavailable, not just the ones that require a web server.  Non HTTP
tests have been salvaged to always run in this script.

* jc/skip-test-in-the-middle:
  t5545: enhance test coverage when no http server is installed
  test: allow skipping the remainder

Merge branch 'bw/forking-and-threading' into maint

The "run-command" API implementation has been made more robust
against dead-locking in a threaded environment.

* bw/forking-and-threading:
  usage.c: drop set_error_handle()
  run-command: restrict PATH search to executable files
  run-command: expose is_executable function
  run-command: block signals between fork and execve
  run-command: add note about forking and threading
  run-command: handle dup2 and close errors in child
  run-command: eliminate calls to error handling functions in child
  run-command: don't die in child when duping /dev/null
  run-command: prepare child environment before forking
  string-list: add string_list_remove function
  run-command: use the async-signal-safe execv instead of execvp
  run-command: prepare command before forking
  t0061: run_command executes scripts without a #! line
  t5550: use write_script to generate post-update hook

Merge branch 'jk/bug-to-abort' into maint

Introduce the BUG() macro to improve die("BUG: ...").

* jk/bug-to-abort:
  usage: add NORETURN to BUG() function definitions
  config: complain about --local outside of a git repo
  setup_git_env: convert die("BUG") to BUG()
  usage.c: add BUG() function

Merge branch 'sb/checkout-recurse-submodules' into maint

"git checkout --recurse-submodules" did not quite work with a
submodule that itself has submodules.

* sb/checkout-recurse-submodules:
  submodule: properly recurse for read-tree and checkout
  submodule: avoid auto-discovery in new working tree manipulator code
  submodule_move_head: reuse child_process structure for futher commands

Configure Git contribution guidelines for github.com

Many open source projects use github.com for their contribution process.
Although we mirror the Git core repository to github.com [1] we do not
use any other github.com service. This is unknown/unexpected to a
number of (potential) contributors and consequently they create Pull
Requests against our mirror with their contributions. These Pull
Requests become stale. This is frustrating to them as they think we
ignore them and it is also unsatisfactory for us as we miss potential
code improvements and/or new contributors.

GitHub contribution guidelines and a GitHub Pull Request template that
is visible to every Pull Request creator can be configured with special
files in a Git repository [2]. Let's make use of this!

[1] https://github.com/git/git
[2] https://help.github.com/articles/creating-a-pull-request-template-for-your-repository/

Signed-off-by: Lars Schneider <larsxschneider@gmail.com>
Helped-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

git-stash: fix pushing stash with pathspec from subdir

The `git stash push` command recently gained the ability to get a
pathspec as its argument to only stash matching files. Calling this
command from a subdirectory does not work, though, as one of the first
things we do is changing to the top level directory without keeping
track of the prefix from which the command is being run.

Fix the shortcoming by storing the prefix previous to the call to
`cd_to_toplevel` and then subsequently using `git rev-parse --prefix` to
correctly resolve the pathspec. Add a test to catch future breakage of
this usecase.

Signed-off-by: Patrick Steinhardt <ps@pks.im>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

t3200: add test for single parameter passed to -m option

Add a test for the case when only one parameter is passed to '-m'
(move/rename) option.

For example - if 'git branch -m bbb' is run while checked out on aaa
branch, it should rename the currently checked out branch to bbb.
There was no test for this particular case with only one parameter
for -m option. However, there's one similar test case for -M option.

Add test for making sure HEAD points to the bbb (new branch name). Also
add a test for making sure the reflog that is moved to 'bbb' retains
entries created for the currently checked out branch. Note that since
the topmost entry on reflog for bbb will be about branch creation, we
compare bbb@{1} (instead of bbb@{0}) with aaa@{0} to make sure the
reflog for bbb retains entries from aaa.

Signed-off-by: Sahil Dua <sahildua2305@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

revision.c: use skip_prefix() in handle_revision_pseudo_opt()

Instead of starts_with() and a bunch of magic numbers.

Signed-off-by: SZEDER Gábor <szeder.dev@gmail.com>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

revision.c: use skip_prefix() in handle_revision_opt()

Instead of starts_with() and a bunch of magic numbers.

Signed-off-by: SZEDER Gábor <szeder.dev@gmail.com>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

revision.c: stricter parsing of '--early-output'

The parsing of '--early-output' with or without its optional integer
argument allowed bogus options like '--early-output-foobarbaz' to slip
through and be ignored.

Fix it by parsing '--early-output' in the same way as other options
with an optional argument are parsed.  Furthermore, use strtoul_ui()
to parse the optional integer argument and to refuse negative numbers.

While at it, use skip_prefix() instead of starts_with() and magic
numbers.

Signed-off-by: SZEDER Gábor <szeder.dev@gmail.com>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

revision.c: stricter parsing of '--no-{min,max}-parents'

These two options are parsed using starts_with(), allowing things like
'git log --no-min-parents-foobarbaz' to succeed.

Use strcmp() instead.

Signed-off-by: SZEDER Gábor <szeder.dev@gmail.com>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

revision.h: turn rev_info.early_output back into an unsigned int

rev_info.early_output started out as an unsigned int in cdcefbc97 (Add
"--early-output" log flag for interactive GUI use, 2007-11-03), but
later it was turned into a single bit in a bit field in cc243c3ce
(show: --ignore-missing, 2011-05-18) without explanation, though the
code using it still expects it to be a regular integer type and uses
it as a counter.  Consequently, any even number given via
'--early-output=<N>', or indeed a plain '--early-output' defaulting to
100 effectively disabled the feature.

Turn rev_info.early_output back into its origin unsigned int data
type, making '--early-output' work again.

Signed-off-by: SZEDER Gábor <szeder.dev@gmail.com>
Reviewed-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

t5100: add some more mailinfo tests

Add some more simple mailinfo tests including a few that
produce:

  fatal: `pos + len' is too far after the end of the buffer

Mark those as 'test_expect_failure'.

Signed-off-by: Kyle J. McKay <mackyle@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'ab/sha1dc-maint' into maint

* ab/sha1dc-maint:
  sha1dc: update from upstream
  sha1dc: ignore indent-with-non-tab whitespace violations

sha1dc: update from upstream

Update sha1dc from the latest version by the upstream
maintainer[1].

See commit a0103914c2 ("sha1dc: update from upstream", 2017-05-20) for
the latest update. That update was done sans some whitespace changes
by upstream, which is why the diff here isn't the same as the upstream
cc46554..e139984.

It also brings in a change[2] upstream made which should hopefully
address the breakage in 2.13.1 on Cygwin, see [3]. Cygwin defines both
_BIG_ENDIAN and _LITTLE_ENDIAN.

Adam Dinwoodie reports on the mailing list that that upstream commit
fixes the issue on Cygwin[4].

1. https://github.com/cr-marcstevens/sha1collisiondetection/commit/e1399840b501a68ac6c8d7ed9a5cb1455480200e
2. https://github.com/cr-marcstevens/sha1collisiondetection/commit/a24eef58c0684078405f8c7a89f9b78271432005
3. <20170606100355.GC25777@dinwoodie.org> (https://public-inbox.org/git/20170606100355.GC25777@dinwoodie.org/)
4. <20170606124323.GD25777@dinwoodie.org> (https://public-inbox.org/git/20170606124323.GD25777@dinwoodie.org/)

Signed-off-by: Ævar Arnfjörð Bjarmason <avarab@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

sha1dc: ignore indent-with-non-tab whitespace violations

The upstream sha1dc code indents some lines with spaces.
While this doesn't match Git's coding guidelines, it's better
to leave this imported code untouched than to try to make it
match our style. However, we can use .gitattributes to tell
"diff --check" and "git am" not to bother us about it.

Signed-off-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

t5313: make extended-table test more deterministic

Commit a1283866b (t5313: test bounds-checks of
corrupted/malicious pack/idx files, 2016-02-25) added a test
that requires our corrupted pack index to have two objects.
The entry for the first one remains untouched, but we
corrupt the entry for second one. Since the index stores the
entries in sha1-sorted order, this means that the test must
make sure that the sha1 of the object we expect to be
corrupted ("$object") sorts after the other placeholder
object.

That commit used the HEAD commit as the placeholder, but the
script never calls test_tick. That means that the commit
object (and thus its sha1) depends on the timestamp when the
test script is run. This usually works in practice, because
the sha1 of $object starts with "fff". The commit object
will sort after that only 1 in 4096 times, but when it does
the test will fail.

One obvious solution is to add the test_tick call to get a
deterministic commit sha1. But since we're relying on the
sort order for the test to function, let's make that very
explicit by just generating a second blob with a known sha1.

Reported-by: Lars Schneider <larsxschneider@gmail.com>
Signed-off-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Git 2.13.1

Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'ah/doc-rev-parse-short-default' into maint

Doc update.

* ah/doc-rev-parse-short-default:
  doc: rewrite description for rev-parse --short

Merge branch 'ah/doc-filter-branch-export-env' into maint

Docfix.

* ah/doc-filter-branch-export-env:
  doc: filter-branch does not require re-export of vars

Merge branch 'sd/t3200-typofix' into maint

Test fix.

* sd/t3200-typofix:
  branch test: fix invalid config key access

Merge branch 'sb/t5531-update-desc' into maint

The description strings for a few tests have been updated.

* sb/t5531-update-desc:
  t5531: fix test description

Merge branch 'ah/doc-pretty-format-fix' into maint

Documentation fix.

* ah/doc-pretty-format-fix:
  Documentation: fix formatting typo in pretty-formats.txt

Merge branch 'ah/doc-interpret-trailers-ifexists' into maint

Documentation fix.

* ah/doc-interpret-trailers-ifexists:
  Documentation: fix reference to ifExists for interpret-trailers

Merge branch 'ab/ref-filter-no-contains' into maint

Doc update to a recent topic.

* ab/ref-filter-no-contains:
  tag: duplicate mention of --contains should mention --no-contains

Merge branch 'sg/core-filemode-doc-typofix' into maint

* sg/core-filemode-doc-typofix:
  docs/config.txt: fix indefinite article in core.fileMode description

Merge branch 'tb/dedup-crlf-tests' into maint

* tb/dedup-crlf-tests:
  t0027: tests are not expensive; remove t0025

Merge branch 'jn/credential-doc-on-clear' into maint

Doc update.

* jn/credential-doc-on-clear:
  credential doc: make multiple-helper behavior more prominent

Merge branch 'jk/url-insteadof-config' into maint

The interaction of "url.*.insteadOf" and custom URL scheme's
whitelisting is now documented better.

* jk/url-insteadof-config:
  docs/config: mention protocol implications of url.insteadOf

Merge branch 'jk/unbreak-am-h' into maint

"git am -h" triggered a BUG().

* jk/unbreak-am-h:
  am: handle "-h" argument earlier

Merge branch 'ab/sha1dc-maint' into maint

The "collision detecting" SHA-1 implementation shipped with 2.13
was quite broken on some big-endian platforms and/or platforms that
do not like unaligned fetches.  Update to the upstream code which
has already fixed these issues.

* ab/sha1dc-maint:
  sha1dc: update from upstream

Merge branch 'js/bs-is-a-dir-sep-on-windows' into maint

"foo\bar\baz" in "git fetch foo\bar\baz", even though there is no
slashes in it, cannot be a nickname for a remote on Windows, as
that is likely to be a pathname on a local filesystem.

* js/bs-is-a-dir-sep-on-windows:
  Windows: do not treat a path with backslashes as a remote's nick name
  mingw.h: permit arguments with side effects for is_dir_sep

Merge branch 'jk/alternate-ref-optim' into maint

A test allowed both "git push" and "git receive-pack" on the other
end write their traces into the same file.  This is OK on platforms
that allows atomically appending to a file opened with O_APPEND,
but on other platforms led to a mangled output, causing
intermittent test failures.  This has been fixed by disabling
traces from "receive-pack" in the test.

* jk/alternate-ref-optim:
  t5400: avoid concurrent writes into a trace file

Merge branch 'bm/interpret-trailers-cut-line-is-eom' into maint

"git interpret-trailers", when used as GIT_EDITOR for "git commit
-v", looked for and appended to a trailer block at the very end,
i.e. at the end of the "diff" output.  The command has been
corrected to pay attention to the cut-mark line "commit -v" adds to
the buffer---the real trailer block should appear just before it.

* bm/interpret-trailers-cut-line-is-eom:
  interpret-trailers: honor the cut line

Merge branch 'kn/ref-filter-branch-list' into maint

"git for-each-ref --format=..." with %(HEAD) in the format used to
resolve the HEAD symref as many times as it had processed refs,
which was wasteful, and "git branch" shared the same problem.

* kn/ref-filter-branch-list:
  ref-filter: resolve HEAD when parsing %(HEAD) atom

Merge branch 'rs/checkout-am-fix-unborn' into maint

A few codepaths in "checkout" and "am" working on an unborn branch
tried to access an uninitialized piece of memory.

* rs/checkout-am-fix-unborn:
  am: check return value of resolve_refdup before using hash
  checkout: check return value of resolve_refdup before using hash

Merge branch 'jn/clone-add-empty-config-from-command-line' into maint

"git clone --config var=val" is a way to populate the
per-repository configuration file of the new repository, but it did
not work well when val is an empty string.  This has been fixed.

* jn/clone-add-empty-config-from-command-line:
  clone: handle empty config values in -c

Merge branch 'ab/c-translators-comment-style' into maint

Update the C style recommendation for notes for translators, as
recent versions of gettext tools can work with our style of
multi-line comments.

* ab/c-translators-comment-style:
  C style: use standard style for "TRANSLATORS" comments

Merge branch 'ls/travis-doc-asciidoctor' into maint

Travis CI gained a task to format the documentation with both
AsciiDoc and AsciiDoctor.

* ls/travis-doc-asciidoctor:
  travis-ci: check AsciiDoc/AsciiDoctor stderr output
  travis-ci: unset compiler for jobs that do not need one
  travis-ci: parallelize documentation build
  travis-ci: build documentation with AsciiDoc and Asciidoctor

Documentation/git-rm: correct submodule description

Since 3ccd681c2a (Merge branch 'sb/submodule-rm-absorb', 2017-01-18)
git-rm tries to absorb any submodules git dir before deleting the
submodule. Correct the documentation to say so.

Signed-off-by: Stefan Beller <sbeller@google.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Prepare for 2.13.1; more topics to follow

Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'tg/stash-push-fixup' into maint

The shell completion script (in contrib/) learned "git stash" has
a new "push" subcommand.

* tg/stash-push-fixup:
  completion: add git stash push

Merge branch 'km/log-showsignature-doc' into maint

Doc update.

* km/log-showsignature-doc:
  config.txt: add an entry for log.showSignature

Merge branch 'jt/use-trailer-api-in-commands' into maint

"git cherry-pick" and other uses of the sequencer machinery
mishandled a trailer block whose last line is an incomplete line.
This has been fixed so that an additional sign-off etc. are added
after completing the existing incomplete line.

* jt/use-trailer-api-in-commands:
  sequencer: add newline before adding footers

Merge branch 'jt/push-options-doc' into maint

The receive-pack program now makes sure that the push certificate
records the same set of push options used for pushing.

* jt/push-options-doc:
  receive-pack: verify push options in cert
  docs: correct receive.advertisePushOptions default

Merge branch 'js/plug-leaks' into maint

Fix memory leaks pointed out by Coverity (and people).

* js/plug-leaks: (26 commits)
  checkout: fix memory leak
  submodule_uses_worktrees(): plug memory leak
  show_worktree(): plug memory leak
  name-rev: avoid leaking memory in the `deref` case
  remote: plug memory leak in match_explicit()
  add_reflog_for_walk: avoid memory leak
  shallow: avoid memory leak
  line-log: avoid memory leak
  receive-pack: plug memory leak in update()
  fast-export: avoid leaking memory in handle_tag()
  mktree: plug memory leaks reported by Coverity
  pack-redundant: plug memory leak
  setup_discovered_git_dir(): plug memory leak
  setup_bare_git_dir(): help static analysis
  split_commit_in_progress(): simplify & fix memory leak
  checkout: fix memory leak
  cat-file: fix memory leak
  mailinfo & mailsplit: check for EOF while parsing
  status: close file descriptor after reading git-rebase-todo
  difftool: address a couple of resource/memory leaks
  ...

Merge branch 'js/eol-on-ourselves' into maint

Make sure our tests would pass when the sources are checked out
with "platform native" line ending convention by default on
Windows.  Some "text" files out tests use and the test scripts
themselves that are meant to be run with /bin/sh, ought to be
checked out with eol=LF even on Windows.

* js/eol-on-ourselves:
  t4051: mark supporting files as requiring LF-only line endings
  Fix the remaining tests that failed with core.autocrlf=true
  t3901: move supporting files into t/t3901/
  completion: mark bash script as LF-only
  git-new-workdir: mark script as LF-only
  Fix build with core.autocrlf=true

Merge branch 'jk/update-links-in-docs' into maint

A few http:// links that are redirected to https:// in the
documentation have been updated to https:// links.

* jk/update-links-in-docs:
  doc: use https links to Wikipedia to avoid http redirects

Merge branch 'jk/ignore-broken-tags-when-ignoring-missing-links' into maint

Tag objects, which are not reachable from any ref, that point at
missing objects were mishandled by "git gc" and friends (they
should silently be ignored instead)

* jk/ignore-broken-tags-when-ignoring-missing-links:
  revision.c: ignore broken tags with ignore_missing_links

Merge branch 'jk/doc-config-include' into maint

Clarify documentation for include.path and includeIf.<condition>.path
configuration variables.

* jk/doc-config-include:
  docs/config: consistify include.path examples
  docs/config: avoid the term "expand" for includes
  docs/config: give a relative includeIf example
  docs/config: clarify include/includeIf relationship

Merge branch 'jk/disable-pack-reuse-when-broken' into maint

"pack-objects" can stream a slice of an existing packfile out when
the pack bitmap can tell that the reachable objects are all needed
in the output, without inspecting individual objects.  This
strategy however would not work well when "--local" and other
options are in use, and need to be disabled.

* jk/disable-pack-reuse-when-broken:
  t5310: fix "; do" style
  pack-objects: disable pack reuse for object-selection options

Merge branch 'jk/am-leakfix' into maint

The codepath in "git am" that is used when running "git rebase"
leaked memory held for the log message of the commits being rebased.

* jk/am-leakfix:
  am: shorten ident_split variable name in get_commit_info()
  am: simplify allocations in get_commit_info()
  am: fix commit buffer leak in get_commit_info()

Merge branch 'jc/read-tree-empty-with-m' into maint

"git read-tree -m" (no tree-ish) gave a nonsense suggestion "use
--empty if you want to clear the index".  With "-m", such a request
will still fail anyway, as you'd need to name at least one tree-ish
to be merged.

* jc/read-tree-empty-with-m:
  read-tree: "read-tree -m --empty" does not make sense

Merge branch 'jc/apply-fix-mismerge' into maint

Mismerge fix.

* jc/apply-fix-mismerge:
  apply.c: fix whitespace-only mismerge

Merge branch 'ja/do-not-ask-needless-questions' into maint

Git sometimes gives an advice in a rhetorical question that does
not require an answer, which can confuse new users and non native
speakers.  Attempt to rephrase them.

* ja/do-not-ask-needless-questions:
  git-filter-branch: be more direct in an error message
  read-tree -m: make error message for merging 0 trees less smart aleck
  usability: don't ask questions if no reply is required