doc/SmallTools/llDataCTFCompensate.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>llDataCTFCompensate</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>llDataCTFCompensate</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: llDataCTFCompensate
  10 Options:
  11     [-i[nput]            In                  (NULL      )] :Essential :InputDataFile
  12     [-I[nput]            In1                 (NULL      )] :Optional  :InputCTFInformation
  13     [-I2[nput]           In2                 (NULL      )] :Optional  :InputCTFInformation2
  14     [-o[utput]           Out                 (NULL      )] :Essential :OutputDataFile
  15     [-t[ruePitch]        truePitch           (430.0     )] :Essential :truePitch[A]
  16     [-m[ode]             mode                (0         )] :Optional  :Mode
  17     [-c[onfig]           configFile          (NULL      )] :Optional  :ConfigurationFile
  18 ----- CTFInformation file 1 -----
  19 RR0 F0 PHI0   : If R.lt.RR0, F0=0; If RR0.le.R.lt.RR1, Linear Interpolation F0, F1
  20 RR1 F1 PHI1   : If RR1.le.R <RR2,
  21 .................................................
  22 RRn Fn PHIn   : If RRn<= R     , F*0     PHI = 0
  23 ----- Control File -----
  24 In[inFile:NULL]                         #InputDataFile
  25 In1[inFile:NULL]                                #InputCTFInformation
  26 Out[outFile:NULL]                               #OutputDataFile
  27 truePitch[Real:100.0]                           #truePitch[A]
  28 mode[Integer:0]                         #Mode
  29 ----- CTFInformation file 2 -----
  30 dF[A] Cs[mm] Acc[kV] ratioOfAmpToPhase
  31 ----- How to make file 1 or file 2 -----
  32 llExtractCtfinfFileCreate make these files.
  33 </PRE>
  34 </BODY>
  35 </HTML>