doc/SmallTools/mrcImage3DPad2.html

   1 <HTML>
   2 <HEAD>
   3 <TITLE>mrcImage3DPad2</TITLE>
   4 </HEAD>
   5 <BODY>
   6 <H1>mrcImage3DPad2</H1>
   7 <H2>Usage</H2>
   8 <PRE>
   9 Usage: mrcImage3DPad2
  10 Options:
  11     [-i[nput]            In                  (NULL      )] :Essential :InputDataFile
  12     [-o[utput]           Out                 (NULL      )] :Essential :OutputDataFile
  13     [-c[onfig]           configFile          (NULL      )] :Optional  :ConfigurationFile
  14     [-r[max]             r                   (0         )] :Optional  :Threshold radius of signal.Default is Nx.
  15     [-w[idth]            w                   (1         )] :Optional  :Width of slope. For mode 1.
  16     [-v[alue]            v                   (0         )] :Optional  :Value of out of threshold.
  17     [-Nx                 Nx                  (0         )] :Optional  :Number of x.Default is inputfile.
  18     [-Ny                 Ny                  (0         )] :Optional  :Number of y.Default is inputfile.
  19     [-Nz                 Nz                  (0         )] :Optional  :Number of z.Default is inputfile.
  20     [-Floating           ] :Optional  :Floating
  21     [-m[ode]             mode                (0         )] :Optional  :Mode
  22     [-M[ode2]            mode2               (0         )] :Optional  :Mode
  23 ----- mode -----
  24 0:Default: Out of threshold is avrage of threshold plain.
  25 1:Mulplying cos function. Default: Out of threshold is avrage of threshold plain.
  26 ----- mode2 -----
  27 0:For filaments.  R is calculated from its axis.
  28 1:For particles.  R is calculated from its center.
  29 </PRE>
  30 </BODY>
  31 </HTML>