サウンドファイルの相対パスの判定に作業ディレクトリが使われていたので、
ショートカットの作業ディレクトリを指定するように修正
[Icons]
Name: "{group}\Readme"; Filename: "{app}\readme.txt"; Tasks: startmenuicon
-Name: "{group}\\83M\83R\83i\83r"; Filename: "{app}\gikoNavi.exe"; Tasks: startmenuicon
-Name: "{commondesktop}\\83M\83R\83i\83r"; Filename: "{app}\gikoNavi.exe"; Tasks: desktopicon
+Name: "{group}\\83M\83R\83i\83r"; Filename: "{app}\gikoNavi.exe"; WorkingDir: "{app}"; Tasks: startmenuicon
+Name: "{commondesktop}\\83M\83R\83i\83r"; Filename: "{app}\gikoNavi.exe"; WorkingDir: "{app}"; Tasks: desktopicon
[Run]
Filename: "{app}\readme.txt"; Description: "README\82ð\95\\8e¦\82·\82é"; Flags: postinstall shellexec skipifsilent unchecked