1 // Copyright ©2017 The Gonum Authors. All rights reserved.
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3 // license that can be found in the LICENSE file.
11 "gonum.org/v1/gonum/mat"
14 func ExampleHOGSVD() {
15 // Perform an HOGSVD factorization on food production/consumption data for the
16 // three years 1990, 2000 and 2014.
18 // See Ponnapalli et al. doi:10.1371/journal.pone.0028072 and
19 // Alter at al. doi:10.1073/pnas.0530258100 for more details.
21 ok := gsvd.Factorize(FAO.Africa, FAO.Asia, FAO.LatinAmericaCaribbean, FAO.Oceania)
23 log.Fatalf("HOGSVD factorization failed: %v", gsvd.Err())
26 for i, n := range []string{"Africa", "Asia", "Latin America/Caribbean", "Oceania"} {
28 s := gsvd.Values(nil, i)
29 fmt.Printf("%s\n\ts_%d = %.4f\n\n\tU_%[2]d = %.4[4]f\n",
30 n, i, s, mat.Formatted(u, mat.Prefix("\t ")))
34 fmt.Printf("\nCommon basis vectors\n\n\tV^T = %.4f",
35 mat.Formatted(v.T(), mat.Prefix("\t ")))
40 // s_0 = [45507.3278 18541.9293 21503.0778]
42 // U_0 = ⎡-0.0005 -0.0039 -0.0019⎤
43 // ⎢-0.0010 -0.0007 -0.0012⎥
44 // ⎢-1.0000 -0.0507 -0.9964⎥
45 // ⎢-0.0022 -0.2906 -0.0415⎥
46 // ⎢ 0.0001 -0.0127 -0.0016⎥
47 // ⎢ 0.0003 -0.0067 -0.0010⎥
48 // ⎢ 0.0003 -0.0022 -0.0003⎥
49 // ⎢-0.0086 -0.9550 0.0734⎥
50 // ⎢ 0.0017 0.0002 0.0059⎥
51 // ⎢-0.0002 -0.0088 -0.0014⎥
52 // ⎢-0.0006 -0.0078 -0.0001⎥
53 // ⎢-0.0005 -0.0076 0.0003⎥
54 // ⎢ 0.0001 -0.0090 0.0008⎥
55 // ⎢-0.0005 -0.0050 0.0029⎥
56 // ⎢-0.0011 -0.0078 -0.0012⎥
57 // ⎢-0.0014 -0.0058 -0.0002⎥
58 // ⎢ 0.0007 -0.0095 0.0020⎥
59 // ⎢-0.0008 -0.0081 -0.0009⎥
60 // ⎢ 0.0004 -0.0092 0.0006⎥
61 // ⎢-0.0007 -0.0079 -0.0006⎥
62 // ⎣-0.0011 -0.0076 -0.0010⎦
64 // s_1 = [77228.2804 8413.7024 14711.1879]
66 // U_1 = ⎡ 0.0005 -0.0080 0.0011⎤
67 // ⎢ 0.0008 -0.0108 0.0016⎥
68 // ⎢-0.9998 0.0612 0.9949⎥
69 // ⎢ 0.0007 -0.5734 -0.0468⎥
70 // ⎢ 0.0001 -0.0265 -0.0022⎥
71 // ⎢ 0.0001 -0.0165 -0.0019⎥
72 // ⎢ 0.0000 -0.0070 -0.0013⎥
73 // ⎢ 0.0196 -0.8148 0.0893⎥
74 // ⎢ 0.0002 -0.0063 0.0012⎥
75 // ⎢-0.0001 -0.0135 -0.0013⎥
76 // ⎢-0.0004 -0.0135 0.0019⎥
77 // ⎢-0.0005 -0.0132 0.0014⎥
78 // ⎢ 0.0003 -0.0155 0.0045⎥
79 // ⎢-0.0003 -0.0130 0.0025⎥
80 // ⎢-0.0007 -0.0105 0.0016⎥
81 // ⎢-0.0006 -0.0129 0.0007⎥
82 // ⎢-0.0006 -0.0178 -0.0023⎥
83 // ⎢-0.0003 -0.0149 0.0016⎥
84 // ⎢-0.0001 -0.0134 0.0030⎥
85 // ⎢-0.0004 -0.0154 0.0010⎥
86 // ⎣-0.0009 -0.0147 -0.0019⎦
87 // Latin America/Caribbean
88 // s_2 = [274.1364 20736.3116 729.6947]
90 // U_2 = ⎡ 0.1060 -0.0021 0.0174⎤
91 // ⎢ 0.1415 -0.0016 0.0289⎥
92 // ⎢ 0.2350 -0.2669 -0.9212⎥
93 // ⎢ 0.0290 -0.0118 -0.0429⎥
94 // ⎢ 0.0226 -0.0043 -0.0213⎥
95 // ⎢ 0.0117 -0.0016 -0.0197⎥
96 // ⎢-0.6263 -0.9635 0.2234⎥
97 // ⎢ 0.2334 -0.0013 0.1275⎥
98 // ⎢-0.0358 -0.0085 -0.0498⎥
99 // ⎢-0.1238 -0.0054 0.0313⎥
100 // ⎢-0.0421 -0.0059 0.0528⎥
101 // ⎢-0.1471 -0.0056 0.0350⎥
102 // ⎢-0.2158 -0.0052 -0.0044⎥
103 // ⎣-0.6154 -0.0078 -0.2717⎦
105 // s_3 = [8954.1914 6942.6316 17233.0561]
107 // U_3 = ⎡-0.0080 -0.0012 -0.0040⎤
108 // ⎢ 0.0004 -0.0014 0.0001⎥
109 // ⎢ 0.9973 -0.0315 0.9991⎥
110 // ⎢ 0.0473 -0.7426 -0.0359⎥
111 // ⎢ 0.0018 -0.0342 -0.0020⎥
112 // ⎢-0.0005 -0.0148 -0.0016⎥
113 // ⎢-0.0004 -0.0047 -0.0007⎥
114 // ⎢-0.0246 -0.6642 -0.0138⎥
115 // ⎢ 0.0003 -0.0287 -0.0023⎥
116 // ⎢-0.0011 -0.0148 -0.0014⎥
117 // ⎢-0.0108 -0.0198 -0.0039⎥
118 // ⎢-0.0149 -0.0183 -0.0048⎥
119 // ⎢-0.0178 -0.0208 -0.0075⎥
120 // ⎢-0.0266 -0.0063 -0.0016⎥
121 // ⎢-0.0012 -0.0234 -0.0006⎥
122 // ⎢-0.0084 -0.0184 -0.0030⎥
123 // ⎢-0.0232 -0.0191 -0.0124⎥
124 // ⎢-0.0072 -0.0226 -0.0035⎥
125 // ⎢-0.0150 -0.0144 -0.0045⎥
126 // ⎢-0.0068 -0.0227 -0.0034⎥
127 // ⎣-0.0127 -0.0136 -0.0049⎦
129 // Common basis vectors
131 // V^T = ⎡-0.0897 -0.4460 -0.8905⎤
132 // ⎢-0.4911 -0.5432 -0.6810⎥
133 // ⎣ 0.0644 0.2841 0.9566⎦